馬英九總統上任 7 年來，總共進行 5 次稅改，不僅使稅制更複雜，且因證所稅開徵形成巨大的稅收損失，也造成台股動能萎縮，難以吸引境外人才。 面對這種狀況，政府若不思改變，台灣經濟可能失控，國家財政與企業競爭力將無可避免地繼續惡化。
今年報稅期間，券商和各地國稅局為了處理股市投資人詢問證所稅申報，被問得非常忙碌，證券商公會祕書長莊太平信手拈來就是一個典型案例。
這個案例凸顯出證所稅申報的複雜程度，已經對許多人造成困擾，莊太平指出，隨著往後須申報證所稅的人數愈來愈多，稅法擾民的程度會逐漸加重。
這就是馬英九總統進行稅改的第一個病症──稅改讓稅法複雜的程度，已非常人可以理解。
馬英九任內目前共進行遺贈稅、證所稅、奢侈稅、富人稅、房地稅五大稅改，其中，降低遺贈稅率、復徵證所稅、奢侈稅 3 項，目前正在實施；而富人稅則是今年首度課徵明年申報的新稅；至於房地合一課所得稅制，現正積極爭取於立法院本會期內通過。其中，證所稅、富人稅、房地稅三項稅改，都與個人綜所稅有關，而三項稅改糾結一起的結果，也讓所得稅法變得複雜無比，往後納稅人可能都要請專業會計師協助報稅，才搞得清楚自己要繳多少稅？
證所稅從 2013 年起開始課徵，就讓大家領教到證所稅的複雜威力了。由於 2013 年課的證所稅，到 2014 年才須申報，財政部長張盛和在 2014 年 6 月向行政院報告證所稅課徵結果時說，2014 年證所稅共申報 8,000 多筆，課到 23.98 億元；但到 2015 年 4 月，財政部各國稅局拿證交所的股市交易檔與證所稅申報檔互相比對，發現 2014 年竟有 4 萬5,000 人應申報而未申報證所稅，顯然有不少人不了解證所稅的申報內容，也不知如何申報，財政部並因此發出輔導函要求這 4 萬 5,000 人補申報證所稅。
但不少投資人依然不清楚證所稅的課稅規定，只好到各地國稅局及向往來券商抱怨並請求協助。對此，券商業者指出，證所稅申報復雜之處，在於賣出的所得及成本非常難計算，目前須課證所稅的標的主要有未上市櫃、興櫃、IPO 三種股票，當投資人賣出前述 3 種股票時，賣出的順序要用「先進先出」方式（先買進先賣出）計算，而成本必須用加權平均法計算（成本除以全部股數），這使得那些對財務與會計沒有基本了解的納稅人，根本很難了解申報內容。
莊太平表示，上述年輕人幫媽媽申報證所稅的例子，就是因為計算太複雜，過程既折騰，成本也實在太高了。據透露，1988 年開徵證所稅時，財政部也曾拿了大筆資料向當時的總統李登輝報告，李總統看到證所稅制與課徵技術都太複雜時，非常驚訝，後來也認為，如此複雜的稅制，必須找出簡便的辦法才能有效課徵。
現在的情況如出一轍；同樣的情況也發生在剛從美國出差返國的一位企業高階主管身上。他說，自己也特地請了兩天假繳稅，「我們不會迴避納稅義務，但勞師動眾就為了課徵這幾十元，稽徵成本太高，且不夠有效率。」
更令人擔心的是，新股 IPO 的股票交易必須課稅，而每年都有新上市櫃的 IPO 股票，因此，往後須申報證所稅的人會愈來愈多，再加上今年實施的富人稅，以及即將推動的房地合一稅（房地合一稅雖未完成立法，但朝野政黨對此分歧不大，極有可能通過），往後納稅人申報綜所稅的難度會愈來愈高。
證所稅除了使稅制變複雜外，也讓馬政府前 3 項稅改成績出現大紅字。
如果拿各稅收的實際課稅數據與各年的預算數（財政部年初預計可課到的數據）相比，從 2008 到 2014 年這 7 年來，調降遺贈稅率、課證交稅以及課奢侈稅 3 項稅改，稅收總共短徵 595 億元！
歸根結柢，造成這 3 項稅改短徵的最主要原因，就是復徵證所稅。最直接衝擊的是證交稅在 2012 到 2014 年，因成交量大幅下滑，證交稅收比預算數足足短徵了 791 億元！
因此，儘管其他稅負有超徵，也彌補不了這將近 800 億元的大洞。
例如，贈與稅收雖然較過去多了 2 倍，但遺贈稅率從 50% 下降到 10% 後，除了 2010 年因經營之神王永慶去世意外繳進的大筆遺產稅外，其餘各年平均稅收約在 240 億元，比過去平均稅收少了 40 億元，但與預算數比，還是超徵。同屬超徵的，還有奢侈稅，但仍彌補不了課徵證所稅造成證交稅的損失。
雪上加霜的是，在證所稅造成的問題還未解決前，再推出挖東牆補西牆的富人稅。前述 3 項稅改合計造成 595 億元稅收短徵，使得政府財政更加吃緊，財政部為了健全政府財政，於 2014 年又推出預估可課到 600 億元的富人稅。然而，富人稅乃是針對年收入千萬元以上者的最高稅率，由 40% 拉高到 45%，同時，將股利所含抵稅權減半，並同步擴大各項扣除額，宣稱只對所得最高的 1 萬人加稅，並對 700 萬人減稅，因此推出半年就獲得立法院通過。但課徵少許的證所稅，卻釀成稅收巨大損失，再以加課富人稅來彌補，即使是先進國家也是令人啼笑皆非的作法。
早知如此，還不如當初不要課證所稅，也就不必如此大費周章地開徵富人稅來補證交稅短徵的大洞了。這也產生極大的後遺症，例如，不少外商投資企業的台籍幹部，為了要避稅，都會要求公司請調海外，或把自己薪資放在像是香港公司支領。
財政部前次長楊子江就指出，富人稅將個人綜所稅最高稅率拉高到 45%，將不利於我國產業吸收境外高階人才。薪資未達國際水準，稅負卻高於國際平均，逼得高階人才待不住台灣，極有可能迫使人才出走，不利於產業競爭力。「現行所得申報的結構中超過 7 成來自薪資，但受薪階級薪水再高，也不是真正的富人，真要調高稅率，應該要從非薪資所得、不動產資本利得上著手才是。」他分析。
對此，5 月 27 日台灣購併與私募股權協會舉行購併論壇時，資誠會計師事務所所長張明輝與多位金融業者，也提到綜所稅的高稅率，已加重台灣企業吸引人才的成本。
國泰金控總經理李長庚表示，對企業來說，高稅率會拉高進用人才的成本，但目前政府財政相當困難，對此，他不敢有太多評論；開發金控總經理楊文鈞則透露，現在很多東南亞大型銀行裡，都有一大票台灣幹部，顯示台灣人才已成為亞洲各金融機構挖角的目標，而國內 45% 的高稅率，遠高於香港與新加坡，也使本地金融業找人才的成本大很多。
但楊文鈞強調，他不想評論政策的對錯，而是要提醒政府，在政策執行後，到底想看到什麼結果？楊文鈞說，對高所得課高稅，雖可增加稅收，但在高稅率下，外國人才自然不太願意到台灣來，而本國優秀人才也容易成為挖角對象，此時，政府須考慮要不要看到這個結果出現！
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